MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis NCIMB 11163 chromosome

Total Repeats: 42074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42001	NC_013355	GGTT	2	8	2121806	2121813	0 %	50 %	50 %	0 %	260754042
42002	NC_013355	CAT	2	6	2121859	2121864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260754043
42003	NC_013355	GTT	2	6	2121866	2121871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260754043
42004	NC_013355	A	6	6	2121912	2121917	100 %	0 %	0 %	0 %	260754043
42005	NC_013355	AGA	2	6	2121942	2121947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260754043
42006	NC_013355	TCA	2	6	2121951	2121956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260754043
42007	NC_013355	AT	3	6	2122055	2122060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42008	NC_013355	AGCGG	2	10	2122097	2122106	20 %	0 %	60 %	20 %	260754044
42009	NC_013355	CTT	2	6	2122164	2122169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260754044
42010	NC_013355	GAACT	2	10	2122218	2122227	40 %	20 %	20 %	20 %	260754044
42011	NC_013355	GCA	3	9	2122266	2122274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260754044
42012	NC_013355	CGT	2	6	2122277	2122282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260754044
42013	NC_013355	AAC	2	6	2122374	2122379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260754044
42014	NC_013355	GCT	2	6	2122389	2122394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260754044
42015	NC_013355	ACTATC	2	12	2122429	2122440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260754044
42016	NC_013355	GCC	2	6	2122467	2122472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260754044
42017	NC_013355	GAA	2	6	2122494	2122499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260754044
42018	NC_013355	GAA	2	6	2122544	2122549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260754044
42019	NC_013355	CGA	2	6	2122640	2122645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260754044
42020	NC_013355	CTT	2	6	2122648	2122653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260754044
42021	NC_013355	GAA	2	6	2122668	2122673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260754044
42022	NC_013355	TCG	2	6	2122714	2122719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260754044
42023	NC_013355	GCA	2	6	2122720	2122725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260754044
42024	NC_013355	GC	3	6	2122730	2122735	0 %	0 %	50 %	50 %	260754044
42025	NC_013355	GAA	2	6	2122746	2122751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260754044
42026	NC_013355	GCT	2	6	2122752	2122757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260754044
42027	NC_013355	TGG	2	6	2122778	2122783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260754044
42028	NC_013355	GCT	2	6	2122800	2122805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260754044
42029	NC_013355	CTT	2	6	2122814	2122819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260754044
42030	NC_013355	AGA	2	6	2122823	2122828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260754044
42031	NC_013355	AAG	2	6	2122894	2122899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260754044
42032	NC_013355	ACT	2	6	2122936	2122941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260754044
42033	NC_013355	CCA	2	6	2122942	2122947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260754044
42034	NC_013355	GTC	2	6	2123004	2123009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260754044
42035	NC_013355	CTT	2	6	2123099	2123104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260754044
42036	NC_013355	GAA	2	6	2123129	2123134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260754044
42037	NC_013355	ACG	2	6	2123214	2123219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260754044
42038	NC_013355	TTGG	2	8	2123314	2123321	0 %	50 %	50 %	0 %	260754044
42039	NC_013355	GCC	2	6	2123331	2123336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260754044
42040	NC_013355	TGGT	2	8	2123380	2123387	0 %	50 %	50 %	0 %	260754044
42041	NC_013355	TTCC	2	8	2123393	2123400	0 %	50 %	0 %	50 %	260754044
42042	NC_013355	ATC	2	6	2123451	2123456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260754044
42043	NC_013355	ATG	2	6	2123500	2123505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260754044
42044	NC_013355	ACA	3	9	2123512	2123520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260754044
42045	NC_013355	AACGGT	2	12	2123559	2123570	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260754044
42046	NC_013355	GAA	2	6	2123706	2123711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260754044
42047	NC_013355	TGC	2	6	2123735	2123740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260754044
42048	NC_013355	CTC	2	6	2123769	2123774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260754044
42049	NC_013355	TAAA	2	8	2123782	2123789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42050	NC_013355	CGGG	2	8	2123826	2123833	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42051	NC_013355	T	7	7	2123835	2123841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42052	NC_013355	GAC	2	6	2123848	2123853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42053	NC_013355	ATG	2	6	2123858	2123863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42054	NC_013355	AGG	2	6	2123868	2123873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42055	NC_013355	T	6	6	2123882	2123887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42056	NC_013355	T	6	6	2123898	2123903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42057	NC_013355	CAA	2	6	2123919	2123924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42058	NC_013355	TTTTC	2	10	2123959	2123968	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42059	NC_013355	GGCT	2	8	2124002	2124009	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42060	NC_013355	AAAAG	2	10	2124021	2124030	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42061	NC_013355	CTT	3	9	2124040	2124048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42062	NC_013355	ATT	2	6	2124061	2124066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42063	NC_013355	TATT	2	8	2124084	2124091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42064	NC_013355	CGC	2	6	2124125	2124130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260754045
42065	NC_013355	A	6	6	2124135	2124140	100 %	0 %	0 %	0 %	260754045
42066	NC_013355	CGT	2	6	2124148	2124153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260754045
42067	NC_013355	TCA	2	6	2124206	2124211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260754045
42068	NC_013355	A	6	6	2124211	2124216	100 %	0 %	0 %	0 %	260754045
42069	NC_013355	TGC	2	6	2124231	2124236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260754045
42070	NC_013355	ATT	2	6	2124285	2124290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260754045
42071	NC_013355	TC	3	6	2124341	2124346	0 %	50 %	0 %	50 %	260754045
42072	NC_013355	CTT	2	6	2124405	2124410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42073	NC_013355	AT	3	6	2124486	2124491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42074	NC_013355	AT	3	6	2124751	2124756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.